Ha az elővetemény kukorica, különösen nagy figyelmet kell fordítani a gyomirtószer maradványokra.

A napraforgó 4–6 hetes koráig, a 35–45 cm-es állománymagasságig érzékeny a gyomosodásra. Később képes elnyomni a gyomokat. A napraforgó gyomirtásának bázisa az ún. alapkezelés. A gyomirtó szereket a talaj típusa, humusztartalma, a talajelőkészítés minősége, elővetemény szármaradványa, valamint a tábla gyomfertőzöttsége alapján kell kiválasztani. Különös figyelmet kell fordítani a kétszikű egyéves gyomok ellen hatékony herbicidekre, mivel nagy részük csak helyzeti szelektivitás alapján használható napraforgóban. (Ez azt jelenti, hogy ha a szer érintkezik a napraforgó csíranövénnyel, akkor azt is elpusztítja.) Ezeket a szereket a vetés után rögtön, még a napraforgó kelése előtt kell kipermetezni. A napraforgó gyomirtásának megoldására rendszerint kombinációkat használunk. Legtöbbször kettő, de néha három készítményt is indokolt alkalmazni. Vannak gyári kombinációk is, ilyen pl. az Igran Combi 500 FW.

A leggyakrabban előforduló gyomnövények az egyszikű (fűfélék) közül a kakaslábfű, muharfélék, vadköles, az évelő fenyércirok és a tarackbúza. Kétszikűek (széleslevelűek) közül a parlagfű, disznóparéjfélék, libatop, keserűfű, selyemmályva, csattanó maszlag, szerbtövis gyakoriak. Sajnos szántóföldjeink egy- és kétszikű gyomokkal egyaránt fertőzöttek.

Három időpontban védekezhetünk a különböző szerekkel (ld. táblázat):

1. Vetés előtt kipermetezve (presoving) és tárcsával vagy kombinátorral 8–12 cm-re bedolgozva. Ez az egyszikűek és néhány kétszikű faj (libatop, disznóparéj) ellen is jó hatású.

2. Vetés után, kelés előtti permetezés (preemergens)

3. Állománykezelés (postemergens)

• A magról kelt kétszikűek ellen: Modown 4 F 1,5 l/ha adagban a gyomnövények szik-kétleveles állapotában kell alkalmazni. (A fellépő fitotoxikus tüneteket a napraforgó kiheveri.)

• Ha gyomos a területünk, és a napraforgó nagyobb, mint a gyomnövények, akkor levél alá permetezéssel oldhatjuk meg a problémát. Ehhez megfelelő szórókeret szükséges. Felhasználható készítmény pl. az Igran 500 FW, 1,5 l/ha dózisban. A szer a kikelt gyomnövényeket leperzseli, míg a napraforgó szárára kerülő szer mennyisége csekély ahhoz, hogy kárt tudjon okozni.

• Egyszikű gyomok elleni állománykezelés: A magról kelő és évelő egyszikű gyomok ellen speciális egyszikűirtó szerekkel védekezhetünk. A magról kelők ellen a gyomok 1–3 leveles korában, ill. a gyökérváltás előtt kisebb adaggal jó hatást tudunk elérni. Az évelők ellen (tarackbúza, fenyércirok, csillagpázsit) azok 10–15 cm-es fejlettségénél érhető el a legjobb hatás.

A napraforgó gyomirtására nagy számú készítmény áll rendelkezésre. Sok tényezőt kell azonban figyelembe venni, hogy a gyomirtás megfelelő legyen.